.cer や .p12 をダブルクリックで追加した時に現れる window で、keychain の追加方法で、login や System を選ぶことができる。

System はシステム全体 (複数ユーザー) でアクセスできる Keychain。システムでアクセスされる keychain はここにおく。login はログインユーザーのみがアクセス可能な Keychain。個々のユーザーごとに制限できる。

自分の macOS を自分一人だけしか使わないのであれば、どちらでも構わないと思う。